Model X/Model S的HEPA空气过滤系统共有三种模式:外循环、内循环以及“生物武器防御”模式。车辆在行驶中会在车厢内部形成负压区,从而导致外部空气携带污染物进入车辆内部,而一般的车辆空气滤芯对污染物的净化作用是有限的。对于特斯拉Model X/Model S搭载的HEPA高效微粒过滤系统而言,用户可以通过一个按钮一键激活“生化武器防御”模式,HEPA空气过滤装置能有效吸收有害气体、粉尘等污染物,并可以在几秒之内将车内臭味清除干净,这项功能对于细菌的过滤能力相比普通车辆提高了300倍。实验证明:HEPA系统在对车内空气迅速净化的同时,也能有效降低周边环境中的污染值。